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标题: 求教蛋白质内两个相邻beta链在拉伸过程中完全分离的判据 [打印本页]

作者
Author: huhq 时间: 2024-5-4 17:41
标题: 求教蛋白质内两个相邻beta链在拉伸过程中完全分离的判据
如何判断蛋白质内两个相邻的、平行排列的beta链在拉伸过程中完全分离？感觉仅用C原子骨架间的氢键是否完全断裂来判断不是很精确，请教各位有无其他判据。多谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-4 18:28
这个判据没明显问题
其它的容易实现的也就是最近原子间距离相对于其范德华半径之和作为判据

作者
Author: huhq 时间: 2024-5-4 21:11
本帖最后由 huhq 于 2024-5-4 21:13 编辑

谢谢sob老师。分析拉伸动力学数据时发现两beta链间的氢键断开、连接，之后再断开、再连接，最终断开，给判断两链断开时的拉伸力带来一定不确定性，还请sob老师能给些建议消除这一不确定性。如果应用最近原子间距离相对于其范德华半径之和作为判据，估计也存在类似问题。

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