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标题: 在生成tpr文件时遇到“fatal error: invalid bond type 0”应该如何解决? [打印本页]

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neoje    时间: 2024-5-4 22:16
标题: 在生成tpr文件时遇到“fatal error: invalid bond type 0”应该如何解决?
各位前辈好,我这边借助cg_param程序,使用martini力场分别对我要研究的聚合物单体及低聚物(聚合度为10)进行粗粒化建模,最终分别生成itp和gro文件如下,但是在预处理生成tpr文件时,粗粒化单体(monopbdt)一切正常,而低聚物(10重复单元)(pbdt)生成tpr文件时出现了“fatal error: invalid bond type 0”的报错,无法生成tpr文件,

我把生成的itp、gro文件以及自己写的mdp文件分别附在下方,恳请各位前辈帮我看看问题到底出在哪,已经困扰好久了,谢谢!






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