计算化学公社
标题:
Gromacs在模拟过程中蛋白质结构的变化,部分残基从Helix变为sheet
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作者Author:
tienan0412
时间:
2024-5-5 21:42
标题:
Gromacs在模拟过程中蛋白质结构的变化,部分残基从Helix变为sheet
各位前辈好。
小生在模拟的过程中发现,用同样进行模拟方法(GROMACS,CHARMM36力场)
模拟结束时发现,几个氨基酸残基,在小分子A和蛋白的复合物位于sheet上,但是在与小分子B与蛋白的复合物中时,氨基酸位于Helix上。请问造成这种情况的原因有可能是什么。
谢谢大家。
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作者Author:
sobereva
时间:
2024-5-5 23:31
和小分子的相互作用可能造成局部蛋白质构象的改变
作者Author:
tienan0412
时间:
2024-5-5 23:48
sobereva 发表于 2024-5-5 23:31
和小分子的相互作用可能造成局部蛋白质构象的改变
嗯嗯。谢谢sob老师。
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