计算化学公社

标题: 求助openbabel进行分子构象生成,输入命令后报错 [打印本页]

作者
Author:
xiewei    时间: 2024-5-6 15:25
标题: 求助openbabel进行分子构象生成,输入命令后报错
老师您好,我想用confab进行分子构象生成,安装了openbabel,但是输入命令后就报错,不知道为啥,我对命令行不太了解

作者
Author:
xiewei    时间: 2024-5-6 16:40
本帖最后由 xiewei 于 2024-5-6 17:04 编辑

我按照将Confab或Frog2与Molclus联用对有机体系做构象搜索 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社 (keinsci.com)这篇文章里的输入文件运行,结果显示出如图的报错,请问如何解决呀
作者
Author:
牧生    时间: 2024-5-6 16:52
你先试试把软件装在非中文的路径下
作者
Author:
xiewei    时间: 2024-5-6 17:03
牧生 发表于 2024-5-6 16:52
你先试试把软件装在非中文的路径下

我一开始放的图不太准确,我后面试了好多次,包括修改输入输出文件为pdb、mol2、xyz格式,都会有下图中的这种报错

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-5-8 06:45
尝试在cmd下运行、尝试Openbabel装到别的目录,并且确保用的是我的帖子里直接提供的openbabel程序




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3