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标题: 模拟结构动力学弛豫后进行变胞优化，是将原子卷回盒子还是重新设置新盒子 [打印本页]

作者
Author: 沙耶NEO 时间: 2024-5-9 20:52
标题: 模拟结构动力学弛豫后进行变胞优化，是将原子卷回盒子还是重新设置新盒子
老师同学们，我想请教一下，我首先手动修改现有cif结构，套用原有正交晶胞，进行变胞优化后得到了一个模拟结构。接着用CP2K做模拟结构的室温弛豫动力学模拟，准备进行变胞优化，有一些原子跑出了盒子。现在想的是
1做变胞优化需不需要建一个更大的正交盒子进行变胞优化
2还是继续使用动力学模拟前的优化后晶胞
3若是2，对于盒子外的原子需不需要卷回盒子进行变胞优化。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-10 23:56
目的不明确，跑动力学意义不明

原子坐标在盒子外面没关系，卷到盒子里时位置正常就行

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