计算化学公社

标题: 关于电化学体系下优化有机分子结构和计算能量的问题 [打印本页]

作者
Author: johngu111 时间: 2024-5-13 18:03
标题: 关于电化学体系下优化有机分子结构和计算能量的问题
各位老师好，我想计算某个有机分子，如苯酚，在电化学体系下的最优构型和单点能。那么有必要在Gaussian中写入电场吗？如果实际电化学体系的电场能量是9V，在Gaussian中该输入多大能量的电场？电场方向该如何确定呢？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-5-13 19:28
电场的单位是V/m，不是V。9V是电压而非电场。
一般电化学体系里的电场远不足以让分子结构有明显变化（起码当分子比较小时如此）。至于什么情况下电场可以强到让分子结构有明显变化，可以看Chem. Soc. Rev., 2018, 47, 5125--5145

作者
Author: johngu111 时间: 2024-5-13 20:53

wzkchem5 发表于 2024-5-13 19:28
电场的单位是V/m，不是V。9V是电压而非电场。
一般电化学体系里的电场远不足以让分子结构有明显变化（起码 ...

好的，谢谢老师

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-14 07:34
常见实验强度的电场容易影响极性分子的整体朝向，或者影响某些容易旋转的极性基团的朝向而令构象变化，而要影响骨架结构是做不到的。参考下文不同大小电场对结构的影响
一篇文章深入揭示外电场对18碳环的超强调控作用
http://sobereva.com/570（http://bbs.keinsci.com/thread-19364-1-1.html）

作者
Author: johngu111 时间: 2024-5-14 09:27

sobereva 发表于 2024-5-14 07:34
常见实验强度的电场容易影响极性分子的整体朝向，或者影响某些容易旋转的极性基团的朝向而令构象变化，而要 ...

谢谢老师，看了您的博文，实验电场可能对分子的电子分布造成影响，如果我想用静电势和ALIE分析分子在这个体系中的活性位点，那是不是必须加上电场？如何设定电场的方向比较合理呢？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-5-14 14:37

johngu111 发表于 2024-5-14 02:27
谢谢老师，看了您的博文，实验电场可能对分子的电子分布造成影响，如果我想用静电势和ALIE分析分子在这个 ...

静电势、ALIE只是近似的判据，首先应当判断实验所用电场对电子分布的影响是否大于静电势、ALIE判断活性位点的误差，如果远小于的话，那么加不加电场都无所谓

作者
Author: johngu111 时间: 2024-5-14 18:00

wzkchem5 发表于 2024-5-14 14:37
静电势、ALIE只是近似的判据，首先应当判断实验所用电场对电子分布的影响是否大于静电势、ALIE判断活性位 ...

这个能用什么办法判断呢？是加电场和不加电场都算一下再比较吗？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-5-14 18:57

johngu111 发表于 2024-5-14 11:00
这个能用什么办法判断呢？是加电场和不加电场都算一下再比较吗？

这样可以，但往往不需要计算，从电场的量级结合经验或者文献就能判断

作者
Author: johngu111 时间: 2024-5-15 12:17

wzkchem5 发表于 2024-5-14 18:57
这样可以，但往往不需要计算，从电场的量级结合经验或者文献就能判断

那请问老师如果加电场的话如何设置电场方向比较合理呢？有没有什么特定的规则或者依据呢？

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-5-15 15:30

johngu111 发表于 2024-5-15 05:17
那请问老师如果加电场的话如何设置电场方向比较合理呢？有没有什么特定的规则或者依据呢？

你必然知道这个加电场的实验是怎么做的，由实验的设计来确定分子和电场的相对取向

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