计算化学公社
标题:
求助:使用CP2K对带Zn晶体结构做TDDFT计算时内存不足报错
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作者Author:
stc980309
时间:
2024-5-15 16:25
标题:
求助:使用CP2K对带Zn晶体结构做TDDFT计算时内存不足报错
我的电脑配置是36核心,128G内存,在计算时运行窗口出现内存不足报错,但是我的体系并不算复杂,按道理说128GB应该是足够的,想请大神们帮忙看看这个内存报错是什么原因引起的?是我的分子数太大了还是我有哪些没有设置正确?我是用的CP2K版本是cp2k.popt版本,MAX_MEMORY 也设置了依旧内存报错。想请大神们帮忙在你们的服务器运行一下,谢谢老师们!附件分别是CP2K的输入文件和晶体结构的cif文件。
作者Author:
sobereva
时间:
2024-5-15 22:52
结构完全离谱
既然是晶体怎么能当非周期性计算
另外,确保看了下文,免得犯低级错误
CP2K做杂化泛函计算的关键要点和简单例子
http://sobereva.com/690
(
http://bbs.keinsci.com/thread-41087-1-1.html
)
作者Author:
stc980309
时间:
2024-5-16 00:49
sobereva 发表于 2024-5-15 22:52
结构完全离谱
既然是晶体怎么能当非周期性计算
十分感谢sob老师指导。
1.结构我也觉得离谱但是是我们实验做出来的,扫单晶衍射仪扫出来的结构,和质谱以及Gaussian结构优化都对的上,所以就采纳了。
2.我再做第一步结构优化的时候是当作周期计算的,第二步做TDDFT计算,参考的第三届
第一性原理计算培训班
的《电子激发与X光谱计算》的第8页PPT中有说到 CP2K的TDDFT不支持K点,因此没有设置K点做周期计算。
3.参考了您的帖子后我仔细对比,发现了最后的问题,问题是我的Cif文件的晶胞尺寸有误,导致晶胞异常大了100倍,使得计算内存占满了。已经找到了问题,感谢sob老师的解答,谢谢老师。
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