计算化学公社

标题: 如何理解盆分析的结果 [打印本页]

作者
Author:
Yuuya    时间: 2024-5-16 17:41
标题: 如何理解盆分析的结果
本帖最后由 Yuuya 于 2024-5-16 17:49 编辑

multiwfn
主功能17 Basin analysis
-> 1 Generate basins and locate attractors
-> 1: Generate the basins by selecting a real space function

-> 1 Electron density
-> 4 Lunatic quality grid

最终结果见附件。

我有几个问题:

为什么attractor的坐标与wfn文件内原子坐标不一致?如果我想一一对应到每个原子,有什么办法吗?

最终结果的value的单位和具体意义是什么?


这种量化分析电子密度的方法,和主功能7 population analysis的11号方法ADCH相比,哪一种准度更高?

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-5-16 20:07
.wfn文件里坐标单位是Bohr,下文说了
利用wfn文件计算电子密度的代码的编写方法
http://sobereva.com/182

而且盆分析基于均匀格点进行分析,吸引子也是落在特定的格点上,通常不可能恰好有一个格点正好和原子核重合

除了极特殊情况外,Multiwfn里没给单位的地方一律是原子单位,手册2.6节一开始就说了。
意义显然就是相应位置的函数的值

跟ADCH原子电荷毫无可比性。先搞清楚盆分析的原理和实际意义再用,看Multiwfn超详细的手册(4.17节有大量例子、3.20节有原理介绍)和相关博文。要用一个功能必须先搞懂它的原理和意义,要么就别用。




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