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标题: 过渡态优化有明显负值eigenvalue，最后频率计算无虚频是什么原因？ [打印本页]

作者
Author: brad_ling 时间: 2024-5-17 13:00
标题: 过渡态优化有明显负值eigenvalue，最后频率计算无虚频是什么原因？
用Gaussian16 进行过渡态优化任务关键词
#p opt=(calcfc,ts,noeigen,nofreeze) freq 6-311+g(d,p) guess=read  um062x

任务正常结束
Normal termination of Gaussian 16 at Thu May 16 10:10:19 2024.
Normal termination of Gaussian 16 at Thu May 16 10:14:53 2024.

$ grep  'Eigenvalues --- -' AA.out
   Eigenvalues --- -0.02758 0.00022 0.00141 0.00385 0.00775
   Eigenvalues --- -0.02550 0.00022 0.00139 0.00392 0.00737
   Eigenvalues --- -0.02587 0.00022 0.00143 0.00392 0.00807
   Eigenvalues --- -0.02598 0.00022 0.00149 0.00392 0.00876
   Eigenvalues --- -0.02565 0.00022 0.00151 0.00392 0.00899
   Eigenvalues --- -0.02534 0.00022 0.00155 0.00392 0.00899
   Eigenvalues --- -0.02515 0.00022 0.00159 0.00392 0.00899
   Eigenvalues --- -0.02498 0.00022 0.00159 0.00391 0.00898
   Eigenvalues --- -0.02488 0.00021 0.00163 0.00390 0.00868
   Eigenvalues --- -0.02495 0.00021 0.00166 0.00389 0.00819
   Eigenvalues --- -0.02510 0.00022 0.00168 0.00388 0.00778
   Eigenvalues --- -0.02522 0.00023 0.00168 0.00386 0.00746
   Eigenvalues --- -0.02519 0.00025 0.00167 0.00378 0.00698
   Eigenvalues --- -0.02503 0.00029 0.00167 0.00359 0.00632
   Eigenvalues --- -0.02482 0.00036 0.00166 0.00326 0.00585
   Eigenvalues --- -0.02479 0.00040 0.00166 0.00297 0.00569
   Eigenvalues --- -0.02492 0.00036 0.00166 0.00287 0.00573
   Eigenvalues --- -0.02496 0.00027 0.00166 0.00288 0.00580
   Eigenvalues --- -0.02494 0.00025 0.00166 0.00298 0.00581
   Eigenvalues --- -0.02491 0.00021 0.00166 0.00303 0.00578
   Eigenvalues --- -0.02489 0.00015 0.00169 0.00304 0.00580
   Eigenvalues --- -0.02489 0.00009 0.00178 0.00302 0.00577
   Eigenvalues --- -0.02486  -0.00034 0.00216 0.00303 0.00582
   Eigenvalues --- -0.02485  -0.00111 0.00279 0.00311 0.00581
   Eigenvalues --- -0.02487  -0.00158 0.00284 0.00346 0.00591
   Eigenvalues --- -0.02486  -0.00128 0.00284 0.00366 0.00594
   Eigenvalues --- -0.02486  -0.00027 0.00281 0.00366 0.00594
   Eigenvalues --- -0.02498 0.00038 0.00190 0.00313 0.00505
   Eigenvalues --- -0.02465 0.00025 0.00092 0.00301 0.00485
   Eigenvalues --- -0.02449 0.00035 0.00140 0.00287 0.00485
   Eigenvalues --- -0.02414 0.00043 0.00152 0.00286 0.00481
   Eigenvalues --- -0.02389 0.00050 0.00171 0.00282 0.00475

最后频率计算无虚频
grep 'Frequencies' AA.out
Frequencies --    12.3121             38.9422             52.7731
Frequencies --    56.1296             63.1460             93.5382
Frequencies -- 101.7566             141.2316             151.0076
Frequencies -- 172.2848             198.9081             214.4991
Frequencies -- 230.8935             242.8249             317.4377
Frequencies -- 363.3635             373.3726             413.1285
Frequencies -- 433.1921             486.1094             522.3230
Frequencies -- 570.9798             608.1146             620.0899
Frequencies -- 658.2377             704.2252             723.2934
Frequencies -- 744.7122             779.2446             788.0564
Frequencies -- 866.7618             929.2262             951.6038
Frequencies -- 961.2149             1021.7574             1024.4368
Frequencies -- 1052.3150             1083.9827             1089.6606
Frequencies -- 1120.7711             1135.4677             1253.1965
Frequencies -- 1327.1779             1369.7424             1439.0630
Frequencies -- 1479.0355             1492.7965             1554.3011
Frequencies -- 1590.6363             1645.2896             1679.2185

结构上明显也是一个过渡态。请问这是什么原因？

作者
Author: Freeman 时间: 2024-5-17 15:50
那些对应的是还没收敛时近似的hessian本征值

作者
Author: 努力学计算 时间: 2024-7-24 08:51

Freeman 发表于 2024-5-17 15:50
那些对应的是还没收敛时近似的hessian本征值

请问老师，我是固定了底层原子来搜的过渡态，成功搜出来了。然后用的这个固定底层原子的模型结构计算频率，在outmol文件里也显示finished successfully，但频率分析的时候，强度那一列都是0，这是因为固定了底层，所以强度都为0嘛，但outmol文件最后提示成功完成，所以我不太明白是不是与底层固定有关，计算频率是不是需要都不固定呀？就是只固定底层原子也不行

作者
Author: Freeman 时间: 2024-7-24 23:07

努力学计算发表于 2024-7-24 08:51
请问老师，我是固定了底层原子来搜的过渡态，成功搜出来了。然后用的这个固定底层原子的模型结构计算频率 ...

这是个新问题了，应该开个新贴。

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