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标题: 用sobtop和LigParGen制作的有机小分子的拓扑文件没有任何参数 [打印本页]

作者
Author: pg-zhd 时间: 2024-5-18 16:01
标题: 用sobtop和LigParGen制作的有机小分子的拓扑文件没有任何参数
本帖最后由 pg-zhd 于 2024-5-18 16:04 编辑

(, 下载次数 Times of downloads: 11) 这是我用sobtop制作的top文件。我用的分子是二氯甲烷
(, 下载次数 Times of downloads: 10) 这是制作top文件的方法

我刚学gromacs还有很多地方不懂，希望大佬能帮忙指点一下！！
感谢感谢！！

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-19 00:14
都不知道你想问什么。拓扑信息不就在sobtop产生的itp文件里

如果拓扑文件基本常识都没有话，强烈建议完整系统性学学基础知识：北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）。这些基本常识不是靠网上答疑来学的

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