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标题: 在判断在判断HIS的质子化状态时,发现它与周围不形成氢键,它还要设置质子化吗? [打印本页]

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Willow0114    时间: 2024-5-19 19:26
标题: 在判断在判断HIS的质子化状态时,发现它与周围不形成氢键,它还要设置质子化吗?
如题,我在判断一个蛋白质在PH=7.4时,各氨基酸质子化状态时,发现有两个HIS需要判断其质子化状态,但是有一个HIS与周围都不形成氢键,是为什么呢?这种情况还需要设置质子化状态吗?


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sobereva    时间: 2024-5-20 02:37
HIS够得到的地方没有氢键受体,自然就没法形成氢键
直接用pKa预测程序给你预测的结果
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Willow0114    时间: 2024-5-20 08:00
感谢您的回复,Pka给我的是6.394,我需要根据氢键的位置判断HID还是HIE,但这个周围没有办法形成氢键,那怎么判断它到底是哪种状态呢?
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sobereva    时间: 2024-5-20 08:20
Willow0114 发表于 2024-5-20 08:00
感谢您的回复,Pka给我的是6.394,我需要根据氢键的位置判断HID还是HIE,但这个周围没有办法形成氢键,那怎 ...

那就无所谓了,质子化在哪都一样
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Willow0114    时间: 2024-5-20 08:27
好的,感谢您的回复!




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