计算化学公社

标题: 如何批量查询Pubchem的CID [打印本页]

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作者
Author: charmm36    时间: 2024-5-21 15:43
标题: 如何批量查询Pubchem的CID
各位老师好，请教一下，我现在有5千个化合物的CAS No.，现在要知道这些化合物在Pubchem中对应CID号，请问有没有什么比较方便的方法？谢谢！

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作者
Author: hamigung    时间: 2024-7-1 10:32

1. import pubchempy as pcp
   
2. 
   
3. # 定义CAS号列表
   
4. cas_numbers = ['64-17-5', '141-43-5', '107-21-1']  # 你要查询的CAS号列表
   
5. 
   
6. for cas_number in cas_numbers:
   
7.     try:
   
8.         compound = pcp.get_compounds(cas_number, 'name')[0]  # 使用CAS号查询化合物信息
   
9.         cid = compound.cid
   
10.         print(f"CAS号 {cas_number} 对应的PubChem CID号为: {cid}")
    
11.     except IndexError:
    
12.         print(f"未找到 CAS号 {cas_number} 对应的化合物信息。")

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