计算化学公社

标题: 约束泛函和非约束泛函选择问题求助 [打印本页]

作者
Author:
Vicky_Sugar    时间: 2024-5-22 18:58
标题: 约束泛函和非约束泛函选择问题求助
我是刚刚接触计算不久的小白,恳请各位老师指点!
我在计算一系列基元反应的活化能和反应的吉布斯自由能变化,一直使用约束泛函m062x6-31+g(d,p)基组进行结构优化、过渡态搜索和IRC验证。但是发现后续的中间产物出现了自由基,并且不确定自由基的位置,所以又使用了非约束泛函um062x6-31+g(d,p)基组对目标分子进行了结构优化+波函数计算,并使用Multiwfn计算了原子自旋布居,得到了未成对电子的位置。
我的问题就产生在这里——如果我想要计算这一系列基元反应的活化能和吉布斯自由能变化,我是否需要保证所有计算步骤都使用相同的泛函和基组?但是如果一个基元反应中如果涉及开壳层分子和闭壳层分子,是不是需要用约束泛函计算闭壳层分子,用非约束泛函计算开壳层分子?我比较了m062x/6-31+g(d,p)um062x/6-31+g(d,p)优化同一个开壳层分子,发现两者的能量计算结果相差很大,对能量计算的结果会有非常大的影响,所以不知道该怎么处理了。
总的来说就是想请教一下各位老师,在处理上述问题的时候,我是否需要在能量计算时统一使用m062x/6-31+g(d,p),在计算原子自旋布居时单独使用um062x/6-31+g(d,p)?需不需要在计算能量时严格区分约束泛函和非约束泛函的使用?十分感谢各位老师!


作者
Author:
wzkchem5    时间: 2024-5-22 21:23
那个不叫约束、非约束,而是叫做限制性、非限制性。而且“限制性、非限制性”修饰的不是“泛函”,而是“计算”。
当体系的自旋多重度不是1时,写m062x/6-31+g(d,p)和um062x/6-31+g(d,p)等价,如果计算结果不同,建议检查是不是其他方面没统一(例如波函数初猜)。当体系的自旋多重度等于1,且已知体系是闭壳层单重态时,m062x/6-31+g(d,p)和um062x/6-31+g(d,p)的结果等价,但后者计算量大。当体系是开壳层单重态时,只写m062x/6-31+g(d,p)或um062x/6-31+g(d,p)而不加其他关键词都是错误的,应该按照http://sobereva.com/82的方法计算。
以上所述所有的结果等价的场合,m062x/6-31+g(d,p)和um062x/6-31+g(d,p)都可以混用,其他场合不能混用
作者
Author:
Vicky_Sugar    时间: 2024-5-23 10:19
wzkchem5 发表于 2024-5-22 21:23
那个不叫约束、非约束,而是叫做限制性、非限制性。而且“限制性、非限制性”修饰的不是“泛函”,而是“计 ...

谢谢老师的指点!目前我优化的这个体系的自旋多重度是3,我又再次检查了m062x/6-31+g(d,p)和um062x/6-31+g(d,p)计算的输入文件和输出文件,发现两者的能量计算结果确实很大,而且对您说的没统一的方面也有些没有头绪,下面是两个输入文件的部分内容,可以烦请老师帮我查看一下导致能量计算差异大的原因吗?
限制性计算输入文件内容:
%mem=10GB
%nprocshared=5
%chk=/home/IM/PS-1-4+O3-12add-IM1-1.chk
#opt freq m062x/6-31+g(d,p) scrf=(smd,solvent=water) int=ultrafine

PS-1-4+O3-12add-IM1-1

0 1
C                  3.44446200   -0.69685100   -1.44272800
C                  4.81143300   -0.28286200   -1.08650700
(其他原子坐标略)

非限制性计算输入文件内容:
%mem=20GB
%nprocshared=5
%chk=/home/IM/PS-1-4+O3-12add-IM1-1-uM062x.chk
#opt freq um062x/6-31+g(d,p) scrf=(smd,solvent=water) int=ultrafine

PS-1-4+O3-12add-IM1-1-uM062x

0 3
C                  3.48457500   -1.78797000   -0.52380100
C                  4.69821200   -1.20385700    0.05526600
(其他原子坐标略)

另外还有三个问题想请教您:
1. 如果我需要使用Multiwfn计算当前体系的原子自旋布居,并得到未成对电子的位置,是否必须使用非限制性计算(如http://sobereva.com/353中所讲的)?
2. 如果反应物是闭壳层单重度的体系,而生成物是开壳层多重度的体系,在搜索过渡态时应该使用限制性计算还是非限制性计算?
3. 如果反应物和产物都是开壳层多重度体系,在搜索过渡态时应该使用限制性计算还是非限制性计算?
再次感谢您!
作者
Author:
wsz    时间: 2024-5-23 11:47
Vicky_Sugar 发表于 2024-5-23 10:19
谢谢老师的指点!目前我优化的这个体系的自旋多重度是3,我又再次检查了m062x/6-31+g(d,p)和um062x/6-31+ ...

1、2、3 均应使用非限制性计算
作者
Author:
Vicky_Sugar    时间: 2024-5-23 13:02
wsz 发表于 2024-5-23 11:47
1、2、3 均应使用非限制性计算

谢谢!
但是1也要用非限制性计算吗?http://sobereva.com/353的2.2节中讲到“之前老有人问怎么他用Multiwfn按下文的例子操作程序不输出自旋布居(Spin pop.),那是因为他的输入文件记录的是闭壳层波函数,闭壳层体系自旋布居全都精确为零,输出这个显然毫无意义,Multiwfn当然不输出!”,请问这句话不是指要用非限制性计算开壳层波函数吗?
作者
Author:
hebrewsnabla    时间: 2024-5-23 15:50
Vicky_Sugar 发表于 2024-5-23 10:19
谢谢老师的指点!目前我优化的这个体系的自旋多重度是3,我又再次检查了m062x/6-31+g(d,p)和um062x/6-31+ ...

自旋多重度不一样,结构(就你展示的前两行来看)也不一样,那能量当然不一样。
作者
Author:
Vicky_Sugar    时间: 2024-5-23 16:11
hebrewsnabla 发表于 2024-5-23 15:50
自旋多重度不一样,结构(就你展示的前两行来看)也不一样,那能量当然不一样。

请问当反应物、过渡态和生成物不都是闭壳层体系时,如何选择限制性和非限制性计算?
作者
Author:
hebrewsnabla    时间: 2024-5-23 16:21
Vicky_Sugar 发表于 2024-5-23 16:11
请问当反应物、过渡态和生成物不都是闭壳层体系时,如何选择限制性和非限制性计算?

楼上两位老师已经回答过了。
作者
Author:
Vicky_Sugar    时间: 2024-5-23 17:19
hebrewsnabla 发表于 2024-5-23 16:21
楼上两位老师已经回答过了。

好的谢谢!




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3