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标题: gmx densmap制作的平面映射图该怎么修改？ [打印本页]

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Author: yiranfengbai 时间: 2024-5-22 20:27
标题: gmx densmap制作的平面映射图该怎么修改？
老师您好，我用gmx densmap -f md.gro -s em.tpr -o densmap.xpm -n index.ndx -aver y -b 0 -e 0 -dmax 1500 -unit count得到xpm文件，然后使用http://bbs.keinsci.com/thread-20056-1-1.html中的脚本得到了eps文件。得到二维密度分布映射图，如图1。希望得到类似文献中图2的效果。目前有几个问题没有得到解决：
1，图2中刻度0~3，应该是指截面模型中Al原子个数。gmx densmap -unit有3种格式：nm-3 nm-2 unit，我该怎么换算得到图2中的刻度呢？
2，我希望把图1修改成长方形，即把横坐标长度变窄，但不修改刻度。主要是为了与晶胞模型相同，该怎么实现呢？另外，可以修改颜色吗？

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