计算化学公社

标题: cp2k跑1000个原子的振动分析需要什么配置 [打印本页]

作者
Author:
stishovite    时间: 2024-5-23 17:05
标题: cp2k跑1000个原子的振动分析需要什么配置
本帖最后由 stishovite 于 2024-5-23 18:23 编辑

本人最近刚开始学习第一性原理计算,对于计算的硬件需求完全没有概念。


我需要用cp2k跑1000个原子体系的振动分析,主族元素,PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH,请问什么样的配置可以在20个小时以内跑完。

全套价格当然是越低越好,预算不超过2w可以搞定吗?请大家帮忙支招。


作者
Author:
sobereva    时间: 2024-5-23 17:17
不说计算级别问这个没意义。诸如GFN-xTB级别跑,几千块钱的二手2*E5-2696v3都完全能跑得动
作者
Author:
stishovite    时间: 2024-5-23 18:05
sobereva 发表于 2024-5-23 17:17
不说计算级别问这个没意义。诸如GFN-xTB级别跑,几千块钱的二手2*E5-2696v3都完全能跑得动

社长你好,我主要用PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH算主族元素
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-5-24 04:32
买双路7R32+512GB机子
目前两万多
淘宝上购买的双路EPYC 7R32 96核服务器的使用感受和杂谈
http://sobereva.com/653
计算化学购机配置推荐
http://sobereva.com/444
作者
Author:
stishovite    时间: 2024-5-24 21:18
sobereva 发表于 2024-5-24 04:32
买双路7R32+512GB机子
目前两万多
淘宝上购买的双路EPYC 7R32 96核服务器的使用感受和杂谈

谢谢社长的回复,您推荐的方案很好,计算化学购机配置推荐http://sobereva.com/444的文章也读了好几遍了,唯一的问题就是2w的价格超预算了。

麻烦再问社长,及各位坛友,有没有单路48核或64核心,价格1.5w左右的方案推荐。

先谢谢大家。
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-5-25 09:40
stishovite 发表于 2024-5-24 21:18
谢谢社长的回复,您推荐的方案很好,计算化学购机配置推荐http://sobereva.com/444的文章也读了好几遍了 ...

整个单路7B13
作者
Author:
天水丨伯约    时间: 2024-6-24 20:06
哥们这几乎不可能。我最近在跑的一个体系,约370个原子,冻结大部分非涉及反应原子,剩下了100个原子跑极度耗时的振动分析也要一两天的时间,用的是课题组师兄按照sob老师推荐的96核双路服务器。总结一下,3万多的服务器,计算级别跟你一样,体系370个原子,冻结绝大部分跑振动分析也至少需要一天。除非你冻结更多的原子或者用更低的级别算,否则完全算不动
作者
Author:
stishovite    时间: 2024-6-27 08:41
天水丨伯约 发表于 2024-6-24 20:06
哥们这几乎不可能。我最近在跑的一个体系,约370个原子,冻结大部分非涉及反应原子,剩下了100个原子跑极度 ...

谢谢哥们分享信息!是的,96核,算是能算动,就是耗时太长,我是刚刚学习第一性原理计算,最近想着从软件优化能否在扣一点性能出来。
作者
Author:
1906593216    时间: 2024-7-25 22:42
sobereva 发表于 2024-5-24 04:32
买双路7R32+512GB机子
目前两万多
淘宝上购买的双路EPYC 7R32 96核服务器的使用感受和杂谈

Sob老师,请问7R32双路这个配置,跑VASP LAMMPS效率还可以吗?
作者
Author:
Eudaimonia    时间: 2024-7-25 23:05
如果是一点冻结都不做,你这个要求得几十到几百W才可能实现
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-7-26 03:58
1906593216 发表于 2024-7-25 22:42
Sob老师,请问7R32双路这个配置,跑VASP LAMMPS效率还可以吗?

可以
lammps最好GPU加速跑
作者
Author:
1906593216    时间: 2024-7-29 09:50
sobereva 发表于 2024-7-26 03:58
可以
lammps最好GPU加速跑

用显卡 RTX 3080 10GB大概5000多块钱左右够用的吗?
作者
Author:
sobereva    时间: 2024-7-30 05:38
1906593216 发表于 2024-7-29 09:50
用显卡 RTX 3080 10GB大概5000多块钱左右够用的吗?

凑合




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3