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标题: 关于阳离子体系的电子密度差解释 [打印本页]

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lycheeho    时间: 2024-5-24 14:58
标题: 关于阳离子体系的电子密度差解释
大家好,我想通过计算两个分子间的气相电荷转移来研究分子间的相互作用。所研究体系是两个相同的带+2价的稠环芳烃分子,分子间距为2.3 A左右根据Sob老师详细的计算步骤,发现分子间有明显的电荷累积,而如果两个分子是中性的话就没有。这样得到的计算结果是否说明对于阳离子体系,两个分子间的相互作用更强,这样分析是否合理?


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wzkchem5    时间: 2024-5-24 15:08
首先,这种足够大的共轭体系的最稳定结合构象是面对面堆积。先用构象搜索把正确的结合构象找到了,再谈别的。
其次,衡量相互作用强弱应该用结合自由能,而非电荷累积
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lycheeho    时间: 2024-5-24 15:16
wzkchem5 发表于 2024-5-24 15:08
首先,这种足够大的共轭体系的最稳定结合构象是面对面堆积。先用构象搜索把正确的结合构象找到了,再谈别的 ...

谢谢您及时的回复!不好意思,是我没有说明白,分子排列方式是按照分子在金属表面的实验图像来排的,目的是定性说明为什么分子采取这样的组装方式。
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wzkchem5    时间: 2024-5-24 15:34
lycheeho 发表于 2024-5-24 08:16
谢谢您及时的回复!不好意思,是我没有说明白,分子排列方式是按照分子在金属表面的实验图像来排的,目的 ...

那就不应该做气相计算,必须考虑金属基底,哪怕金属基底用一个很低的理论级别也行。金属基底对分子间作用影响很大
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lycheeho    时间: 2024-5-24 16:09
wzkchem5 发表于 2024-5-24 15:34
那就不应该做气相计算,必须考虑金属基底,哪怕金属基底用一个很低的理论级别也行。金属基底对分子间作用 ...

确实,但是考虑金属就会复杂很多,想着能不能利用简单的气相模型来解释,谢谢您!




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