计算化学公社

标题: 求助H进攻氧的灵敏的TS应该怎么调整 [打印本页]

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Author: 吴双 时间: 2024-5-26 20:41
标题: 求助H进攻氧的灵敏的TS应该怎么调整
本帖最后由吴双于 2024-9-23 22:02 编辑

大家好，我用高斯找一个TS的结构，想找的结构是64号H进攻49号氧，设置了49-64（O-H的距离是1.1885）64-62（H-C的距离是1.2239）做限制性优化，主要的虚频是我预期的结果，但是放开结构之后，跑向了反应物。后续缩短49-64的距离，变成1.1865，进行限制性优化，直接优化成了生成物，想跟大家请教下，对于这类很灵敏的TS应该怎么调整呢。（文件1是限制49-64为1.1885的输出文件，文件2对应其放开的输出文件，文件3是限制49-64为1.1865的输出文件[attach]91887[/attach]）

作者
Author: 黑色桃花 时间: 2024-5-26 20:50
同问，但是你可以首先试下溶剂模型，我也遇到一样的问题了

作者
Author: 吴双 时间: 2024-5-26 20:51

黑色桃花发表于 2024-5-26 20:50
同问，但是你可以首先试下溶剂模型，我也遇到一样的问题了

试下溶剂模型的意思是更换下别的么？

作者
Author: 黑色桃花 时间: 2024-5-26 21:02

吴双发表于 2024-5-26 20:51
试下溶剂模型的意思是更换下别的么？

不是，你看下我新问的帖子，再看下smd这些你就懂了，老师啥都给讲的明明白白的，我记得帖子说过凝聚态要用溶剂模型

作者
Author: dnlx 时间: 2024-5-26 23:39
"对于这类很灵敏的TS应该怎么调整呢"--我碰到这种情况只能用ORCA的NEB-TS（但是有时候最后一步也会游走）。不知道高斯QST3是不是同一效果。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-27 05:37
在关键词、各种设定没有硬伤的情况下，适当简化体系然后做较小步长的柔性扫描以确定合适的过渡态初猜，同时也可以用于确认是否有过渡态

1.log的结构本身就非常奇怪，怎么会O18、O49两个O直接挨着

没事甭用CPCM，下文明确说了
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327（http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html）

作者
Author: 吴双 时间: 2024-5-27 09:32
本帖最后由吴双于 2024-9-23 22:02 编辑

sobereva 发表于 2024-5-27 05:37
在关键词、各种设定没有硬伤的情况下，适当简化体系然后做较小步长的柔性扫描以确定合适的过渡态初猜，同时 ...

老师这个TS, 我之前做过柔性扫描，扫描的键长是64-49距离缩短的过程，步数是15步，步长-0.1，存在最高点，证明这个过程存在TS。我取柔性扫描最高点附近的点进行小步长扫描的再试试。49和18这两个氧原子直接相连与过氧化氢中H-OOH的原理类似。

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