计算化学公社
标题:
求助离子液体萃取喹啉,实验结果和模拟结果不一致
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作者Author:
luodandan
时间:
2024-5-30 10:02
标题:
求助离子液体萃取喹啉,实验结果和模拟结果不一致
老师好,我想问一下,就是我用离子液体萃取喹啉,实验得到的萃取效果还行。用分子动力学模拟,效果很差,看了一下它和其它原子的径向分布函数,几乎没有相互作用,这会不会是因为酸碱作用,而不是氢键作用。那酸碱作用可以用分子模拟来计算吗
作者Author:
Seyilaxa
时间:
2024-5-30 11:33
酸碱作用在动力学上的体现就是结构的改变,比如酸碱基团上是否有质子化的差别
模拟和实验结果不一致的原因可太多了,首先关心一下用的力场和原子电荷合不合适,然后还要考虑其他的模拟细节
作者Author:
sobereva
时间:
2024-5-30 15:22
分子力场对相互作用的描述上没有所谓的“酸碱作用”,也没有专门的氢键作用(只有极少数力场有专门的氢键项)。主流的力场描述的非键作用只有静电作用和范德华作用,一般强度的氢键本质是静电作用(
http://sobereva.com/513
)、主要靠静电作用项描述。你得确保计算设置得当,诸如原子电荷合理、分子的质子化态合理,才能确保静电作用能如实描述。
作者Author:
luodandan
时间:
2024-5-30 19:40
好的谢谢老师
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