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标题: GPU发展与计算化学的问题 [打印本页]

作者
Author: Miska_Mikoto 时间: 2024-5-30 11:47
标题: GPU发展与计算化学的问题
得益于GPU的发展，将并行计算通过GPU处理能够极大的提升计算速率。我所在的课题组主要做的是分子模拟，使用的pygamd软件可以通过GPU大幅度提升计算速率。为什么鲜有人开发GPU加速的量子化学计算程序或者其他的分子动力学计算程序，以此提高计算速度？量子化学中也大量存在对矩阵的操作，如果用GPU加速应该会有不错的提升？

作者
Author: RAL 时间: 2024-5-30 13:14
Gaussian、VASP、CP2K等著名量子化学软件都有GPU版本，VASP的加速性价比好一些

作者
Author: sobereva 时间: 2024-5-30 17:30
支持GPU加速的多了去了，看北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）这页ppt：

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量子化学和经典力场的分子动力学的GPU加速情况有天壤之别。量子化学领域GPU加速很难起到实际价值。当前GPU产品的双精度性价比太低，而且量子化学的最耗时那些部分的算法的复杂度远高于分子动力学，GPU加速效果普遍很有限，不是把矩阵操作用GPU加速就能轻易起到效果的。诸如对于Gaussian的常规DFT计算，矩阵操作并不是决定耗时的关键，双电子积分和交换-相关泛函的积分的计算才是。

作者
Author: Miska_Mikoto 时间: 2024-5-31 19:53

sobereva 发表于 2024-5-30 17:30
支持GPU加速的多了去了，看北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_con ...

感谢老师的回答！我意识到我产生这样的问题是因为我对量子化学计算的细节和原理缺乏清晰的了解，还需要更深入的学习。

作者
Author: xyan11 时间: 2025-3-4 15:19
亲身体验，千万不要用GH200去跑CP2K，比A100还慢！有一颗好的x86_64的CPU还是很重要的。回头我得想想怎么和老板解释浪费掉的超算资源。

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