计算化学公社

标题: packmol填充完后怎么生成拓朴文件和gro文件呢？ [打印本页]

作者
Author: samuel 时间: 2024-5-30 20:18
标题: packmol填充完后怎么生成拓朴文件和gro文件呢？
想问问packmol填充完后怎么生成拓朴文件和gro文件呢？

作者
Author: 牧生 时间: 2024-5-30 20:34

详见 http://sobereva.com/soft/Sobtop/

特别要阅读FAQ 4：

作者
Author: 平湖片帆 时间: 2024-5-31 14:17
GRO文件很容易生成吧，gmx editconf .......
拓朴文件的话，你需要预先生成体系中单个分子的拓朴文件（一般以itp结尾），然后在topol.top里面引用这些文件，并且注明他们的重复次数

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