计算化学公社
标题:
CP2K如何消除碳纳米管内的水分子的质心漂移?
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作者Author:
Alset
时间:
2024-5-31 13:19
标题:
CP2K如何消除碳纳米管内的水分子的质心漂移?
老师们好,
我在使用cp2k-aimd模拟碳纳米管里结冰时,固定了碳原子,并且设置COMVEL_TOL和ANGVEL_TOL为0,但仍发现内部水分子存在质心漂移的情况,而碳原子往相反的方向发生了运动。
具体情况如下图所示:
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目前认为这些水分子是以冰的形式存在,因为水分子并没有像液态一样发生明显的旋转,这也可以从旋转自相关函数得到印证。但由于水发生漂移,我在计算水分子扩散系数时,得到了不合理的偏大结果。
请问目前设置有什么不合理的地方,以及该如何解决以上问题呢?附件是该模拟的输入、输出以及轨迹文件。
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