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标题: 质子转移做柔性扫描能量一直上升是否可以说明不存在过渡态 [打印本页]

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Sui1999    时间: 2024-5-31 15:05
标题: 质子转移做柔性扫描能量一直上升是否可以说明不存在过渡态
各位老师好,我在找一个质子转移的过渡态,反应物如图所示,产物是44号H连到59号O上,换了多个初猜都没有找到,于是就对59和44这两个原子做了键长的柔性扫描,发现能量随着两原子之间距离的缩短是逐步上升的,那我便以为这个反应的逆反应是无能垒反应,我对产物进行柔性扫描,即初始结构44号H接在59号O上,然后对44号H和43号O做柔性扫描,发现能量也是随着距离的缩短逐步上升,也就是说H无论是脱离59号O去和43号O结合,还是脱离43号O去和59号O结合都是不利的。
想问一下为何会出现这种情况,这说明H转移是十分困难的吗?

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candicechen    时间: 2024-6-13 15:13
请问楼主找到原因了吗?我目前也遇到了这个问题
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Sui1999    时间: 2024-6-15 16:38
candicechen 发表于 2024-6-13 15:13
请问楼主找到原因了吗?我目前也遇到了这个问题

目前过渡态一直没找大,你可以用跑个AIMD看一下
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wzkchem5    时间: 2024-6-15 17:00
只要扫描范围足够宽,扫描步长足够小,发现能量单调变化,就说明是无垒反应。
逆反应是无垒反应并不一定说明反应困难,要判断反应是否困难,仍然需要计算活化Gibbs自由能,为求准确可以用比如说Baik的方法(http://dx.doi.org/10.1021/acs.organomet.8b00456)。不同方法(直接取Gibbs自由能变;Baik法;VRC-TST;AIMD)的优劣,我之前在论坛上总结过,很容易搜到
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duan1007    时间: 2025-3-19 10:22
楼主找到了吗?我也遇到了类似的问题。目前也是做柔性扫描结果是一条光滑曲线

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Sui1999    时间: 2025-4-3 22:02
duan1007 发表于 2025-3-19 10:22
楼主找到了吗?我也遇到了类似的问题。目前也是做柔性扫描结果是一条光滑曲线

可以参考楼上王老师的建议
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duan1007    时间: 2025-4-7 14:15
Sui1999 发表于 2025-4-3 22:02
可以参考楼上王老师的建议

多谢




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