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标题: 求助gromacs使用gpu加速时提示gpu未连接 [打印本页]

作者
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zhangfaxue    时间: 2024-5-31 16:05
标题: 求助gromacs使用gpu加速时提示gpu未连接
本帖最后由 zhangfaxue 于 2024-5-31 16:10 编辑

GROMACS version:    2021.2-UNCHECKED
Command line:
  gmx mdrun -v -deffnm npt -s npt.tpr -pme gpu -nb gpu -ntomp 12 -pin on -ntmpi 1 -update gpu

提示错误:

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请问是我的体系无法使用gpu加速造成的吗?还是什么原因,应该如何处理?
不使用-update gpu选项时也是同样提示,另外想问一下该选项是用于控制什么,手册上没有找到具体的
(, 下载次数 Times of downloads: 4) (, 下载次数 Times of downloads: 0)






作者
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sobereva    时间: 2024-5-31 17:02
确保GPU驱动装好了、gromacs的GPU版以正确的方式编译了
如果之前都没问题,重启再试
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zhangfaxue    时间: 2024-5-31 17:30
sobereva 发表于 2024-5-31 17:02
确保GPU驱动装好了、gromacs的GPU版以正确的方式编译了
如果之前都没问题,重启再试

老师我使用的超算,由于是新开节点并且新装的软件,但是对方觉得是我算例有问题,但是我检查了没有问题,所以我想确认一下是否是我本身体系及设置的原因
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lmch    时间: 2024-5-31 22:02
超算装2021.2也太不专业了
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zhangfaxue    时间: 2024-6-1 09:35
lmch 发表于 2024-5-31 22:02
超算装2021.2也太不专业了

这个版本有什么问题吗
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sobereva    时间: 2024-6-1 10:17
zhangfaxue 发表于 2024-5-31 17:30
老师我使用的超算,由于是新开节点并且新装的软件,但是对方觉得是我算例有问题,但是我检查了没有问题, ...

log里可见
(GPU detection failed)

明显是他们装的问题




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