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标题: 求助键解离计算过程和结果是否正确 [打印本页]

作者
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xxtnenu    时间: 2024-5-31 22:50
标题: 求助键解离计算过程和结果是否正确
请问各位老师,学生的计算过程和结果是否正确?


首先参照《使用Molclus结合xtb做的动力学模拟对瑞德西韦(Remdesivir)做构象搜索》(http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html),对化合物进行了构象搜索,由于实验体系不是在溶剂相,因此没有计算溶解自由能。获得能量最低的构象后,使用B3LYP/6-311G(d,p) em=gd3bj进行结构优化,再使用m062x/ma-tzvp计算单点能。再通过Shermo程序,修改参数包括能量、温度、压强、sclZPE和ilowfreq计算自由能和和焓。再通过部分(自由基)与整体的焓相减得到相应的键解离能。





作者
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sobereva    时间: 2024-6-1 10:02
我没时间看具体文件,从你的描述上看没有问题
作者
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xxtnenu    时间: 2024-6-2 00:06
sobereva 发表于 2024-6-1 10:02
我没时间看具体文件,从你的描述上看没有问题

收到,谢谢老师回复




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