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标题: 蛋白质里只有PRO HYP GLY三种氨基酸，如何设置它在不同PH下的情况 [打印本页]

作者
Author: Willow0114 时间: 2024-6-1 15:10
标题: 蛋白质里只有PRO HYP GLY三种氨基酸，如何设置它在不同PH下的情况
我的蛋白质在实验过程中，一直处于弱碱性的环境下，在模拟的时候我本来想通过设置氨基酸的质子化的状态来进行模拟，但是我发现gromacs里不能设置这三种氨基酸的质子化状体，那我应该怎么处理才能尽可能接近实验条件呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-1 17:08
诸如甘氨酸，都没有侧链，弱碱性也不会影响质子化态

作者
Author: Willow0114 时间: 2024-6-3 09:16
好的，谢谢sob老师

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