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标题: 模型里加入两个小分子后能量最小化出现错误 [打印本页]

作者
Author: 萧萧儿 时间: 2024-6-3 17:36
标题: 模型里加入两个小分子后能量最小化出现错误
在TIP3P的水分子模型里加入两个小分子后，进行了能量最小化，出现了如图一所示的错误，当我把所提示的settle删除之后，又出现了如图二所示的错误。麻烦各位大佬告知一下如何操作

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-3 18:28
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “gromacs 模拟” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-3 18:29
拓扑文件内容不对。上传拓扑文件

每个图片都必须手动插入帖子，仔细看置顶的社员必读贴，否则图1、图2别人都不知道说的是哪个

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