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标题: 求助,使用VMD计算氢键时,H-C元素间形成氢键并显示,该如何取消 [打印本页]

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shiguang123    时间: 2024-6-3 22:31
标题: 求助,使用VMD计算氢键时,H-C元素间形成氢键并显示,该如何取消
改写老师计算氢键的脚本来计算体系中一定范围溶剂壳层内氢键数目时,用到的命令为
llength [lindex [measure hbonds 3.5 40 $selc] 0]

发现对于H2O分子计算出来的数目是正确的,对于其它分子我发现出现了H-C元素间形成的氢键,想请教一下如何设置才能让脚本只计算分子中极性原子间形成的氢键呢?
并且显示时只显示极性原子间形成的氢键


作者
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sobereva    时间: 2024-6-3 22:53
选择语句里把碳排除掉




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