计算化学公社

标题: 求一个可正常使用GPU加速的算例用于测试 [打印本页]

作者
Author:
zhangfaxue    时间: 2024-6-4 09:26
标题: 求一个可正常使用GPU加速的算例用于测试
求助gromacs使用gpu加速时提示gpu未连接
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 1&fromuid=55969
(出处: 计算化学公社)

如上篇帖子所示,向超算工程师反应多次后并为得到解决,对方表示其他人均可正常使用,觉得是我本身算例存在问题,且对方表示自己没有标准算例进行测试,所以想寻求一个确认能够进行GPU加速的算例用于测试


作者
Author:
sobereva    时间: 2024-6-4 12:42
自己建个水盒子的例子就完了,GPU加速的输入文件没有任何特殊性(只要避免用一些GPU版不支持的特性就完了,诸如能量组)
作者
Author:
snljty2    时间: 2024-6-4 16:53
比如这个文件
benchMEM.zip
来自这个网站
A free GROMACS benchmark set
用搜索引擎搜gromacs free benchmark就能搜到,很多人用过这个例子做性能测试
至于你那个问题,大概要么是显卡驱动/CUDA/Gromacs没装好,要么有些环境变量设的不对,屏蔽了能用的GPU。
作者
Author:
zhangfaxue    时间: 2024-6-5 09:09
sobereva 发表于 2024-6-4 12:42
自己建个水盒子的例子就完了,GPU加速的输入文件没有任何特殊性(只要避免用一些GPU版不支持的特性就完了, ...

谢谢老师
作者
Author:
zhangfaxue    时间: 2024-6-5 09:09
snljty2 发表于 2024-6-4 16:53
比如这个文件
benchMEM.zip
来自这个网站

好的谢谢,我去看看




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