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标题: MSD应该是在NPT下还是在成品区间采样的问题 [打印本页]

作者
Author: jlyjlysjd 时间: 2024-6-5 18:08
标题: MSD应该是在NPT下还是在成品区间采样的问题
本帖最后由 jlyjlysjd 于 2024-6-5 18:29 编辑

我想讨论溶液浓度对离子电导率的影响。
请问MSD是不是应该在体系已经完全平衡时进行采样呢，也就是在成品模拟中采样呢，但是我看有一篇教程却是在NPT中进行取样的，这一点我比较疑惑。
我的NPT是采用退火模拟到298K。
请问对于浓度与离子电导率的关系这个问题，应该是在NPT下采样呢还是在成品模拟中采样呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-5 19:07
不要乱用NPT这个词
我已经回复过不知多少回了，NPT是动力学过程用的系综，只能说比如“平衡相阶段用了NPT系综”、“用NPT系综做了产生相模拟”等等。所谓的“成品”（正确叫法是“产生相”）和NPT根本不是一个层面的概念。NPT、NVT、NVE等是一个层面的，平衡相和产生相是一个层面的。“在NPT中进行取样的”完全属于莫名其妙的描述

一些教程里乱用词，绝对不要效仿。

作者
Author: jlyjlysjd 时间: 2024-6-5 19:23

sobereva 发表于 2024-6-5 19:07
不要乱用NPT这个词
我已经回复过不知多少回了，NPT是动力学过程用的系综，只能说比如“平衡相阶段用了NPT ...

好的sob老师，那这个问题就是：我想统计不同浓度对离子迁移率的影响，那统计MSD是不是应该在在产生相中统计呢，而不应该在平衡相内统计呢？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-5 21:36

jlyjlysjd 发表于 2024-6-5 19:23
好的sob老师，那这个问题就是：我想统计不同浓度对离子迁移率的影响，那统计MSD是不是应该在在产生相中统 ...

是

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