计算化学公社
标题:
多肽自组装,如何构建多个两分子体系。使两分子的初始结构相对位置保持一致
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作者Author:
mtpeng
时间:
2024-6-6 11:59
标题:
多肽自组装,如何构建多个两分子体系。使两分子的初始结构相对位置保持一致
各位老师好,对于多肽自组装模拟,我目前的策略是二聚体模拟,构建相距一定距离的两分子初始结构进行模拟,因为需要对比多个多肽序列,所以需要保证初始结构中两分子相距的距离相同(或者说如何排除这个变量的影响),这可以如何实现?
作者Author:
sobereva
时间:
2024-6-7 00:20
写VMD脚本,获得两个分子间最近距离及对应的两个原子,然后将要求的距离与当前距离求差,顺着两个原子方向移动相应距离即可
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