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标题: 【求助】GAMESS编译问题 [打印本页]

作者
Author: Tinker 时间: 2014-12-16 07:19
标题: 【求助】GAMESS编译问题
各位老师：
你们好！

问题是这样的，我想尝试在学校的超算平台上编译GAMESS，参考的是这一个编译流程，解压 → config → compddi → compall → lked → 编辑rungms
http://emuch.net/html/201305/5911413.html，
学校的数学库没有mkl，但是有ACML和altas。我选了ACML
在编译到“lked”环节的时候报错了，

“collect2: ld returned 1 exit statusUnfortunately, there was an error while linking GAMESS.”

是由于没有链接到数学库导致的吗？求助，谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2014-12-16 17:28
编译方法建议参考
GAMESS-US 2013-May版编译方法
http://sobereva.com/193
GAMESS-US 2011-Aug-11版编译方法
http://sobereva.com/105
GAMESS(US) 2009 R3版编译方法
http://sobereva.com/50

这只是提示是连接库的时候出错，但不一定就是数学库。

作者
Author: Tinker 时间: 2014-12-17 10:21

sobereva 发表于 2014-12-16 17:28
编译方法建议参考
GAMESS-US 2013-May版编译方法
http://sobereva.com/193

谢谢Sob老师，
我咨询了工作人员，他们给我了mkl的路径，按照您给的流程，编译成功了，可以在登录节点上算个小任务。
可是接下来不太清楚PBS脚本的写法,有哪些环境变量需要export呢，rungms需要修改吗？
排队系统是Torque 2.5，

作者
Author: zhanfei 时间: 2014-12-17 14:03

Tinker 发表于 2014-12-17 10:21
谢谢Sob老师，
我咨询了工作人员，他们给我了mkl的路径，按照您给的流程，编译成功了，可以在登录节点上 ...

先#PBS设置参数，然后写运行命令的部分。网上搜下很多，一般集群也会稍微改动下不是纯的tor系统需要咨询集群管理人员

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