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标题: 求助：在稀溶液中的相互作用能计算 [打印本页]

作者
Author: 马天湉 时间: 2024-6-10 21:18
标题: 求助：在稀溶液中的相互作用能计算
请问：我用GROMACS做了1个离子液体和1023个溶剂分子的动力学模拟,离子液体为[BmimOAC],溶剂分子是H2O,为什么算出来OAC-OAC间相互作用能是负值？阴离子和阴离子间相互作用不应该是正的，相互排斥吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-10 23:33
看不懂你的情况
当前就一个[BmimOAC]，算OAC和OAC的相互作用相当于算离子内的相互作用，不是你说的“阴离子和阴离子间”

作者
Author: 马天湉 时间: 2024-6-11 08:34

sobereva 发表于 2024-6-10 23:33
看不懂你的情况
当前就一个，算OAC和OAC的相互作用相当于算离子内的相互作用，不是你说的“阴离子和阴离子 ...

感谢老师回复，当前只有一个[BmimOAC],但是在计算相互作用能的时候Coul-SR:OAC-OAC相互作用能是-49.62(kJ/mol）；LJ-SR:OAC-OAC是0 ; Coul-14是-40.38；LJ-14是0.76；是不是离子内的相互作用得是（Coul-14）+（LJ-14）？离子间相互作用能为0，因为只有一个OAC-？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-12 02:59

马天湉发表于 2024-6-11 08:34
感谢老师回复，当前只有一个,但是在计算相互作用能的时候Coul-SR:OAC-OAC相互作用能是-49.62(kJ/mol）； ...

当前不存在离子间相互作用

Coul-SR:OAC-OAC是离子内的静电相互作用（前提是你用的cutoff方式算的静电作用，而且cutoff方式构建邻居列表）
LJ-14是离子内的1-4范德华作用

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