计算化学公社

标题: 怎么衡量某位置的氢的酸性？很弱的氢键强度的算法？ [打印本页]

作者
Author: lukas 时间: 2024-6-10 22:24
标题: 怎么衡量某位置的氢的酸性？很弱的氢键强度的算法？
本帖最后由 lukas 于 2024-6-11 12:22 编辑

怎么衡量某位置的氢的酸性？化学键长或者极性可以表示吗？
很弱的氢键（没有BEP（此处是BCP,键临界点）)强度的算法？BEP（此处是BCP,键临界点）处的电子密度可以说明氢键强度，如果没有CVB，衡量是否可行？
谢谢各位。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-10 23:19
不要用不常见的缩写，别上来就写个BEP，几乎不会有人知道你在说什么。键临界点叫BCP，不叫BEP

衡量酸性算pKa，可以直接用量子化学方法算绝对的pKa，公社论坛上搜，北京科音中级量子化学培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html）里讲溶剂模型的部分我详细全面讲了怎么计算。要么对一批类似体系算一些描述符横向对比pKa，比如Multiwfn算H的Hirshfeld电荷（参考Journal of Computational Chemistry 2018, 39, 117–129）、原子核位置的静电势（看下文）等等
谈谈怎么计算“原子的静电势”
http://sobereva.com/641（http://bbs.keinsci.com/thread-29998-1-1.html）

H的酸性和氢键强弱是两码事，说清楚到底想研究什么

作者
Author: lukas 时间: 2024-6-11 08:02
本帖最后由 lukas 于 2024-6-11 12:16 编辑

sobereva 发表于 2024-6-10 23:19
不要用不常见的缩写，别上来就写个BEP，几乎不会有人知道你在说什么。键临界点叫BCP，不叫BEP

衡量酸性 ...

抱歉老师。是键临界点，没检查一下。两者我知道区别。我想一起提出两个简单的问题，以免占据太多帖子。那这个CVB指数几乎可以衡量所有‘三体’，如果只是定性比较是否足够了，我想问传统意义上无氢键的如（S和H），这样得出的数值还有比较意义吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-12 02:38

lukas 发表于 2024-6-11 08:02
抱歉老师。是键临界点，没检查一下。两者我知道区别。我想一起提出两个简单的问题，以免占据太多帖子。那 ...

我不知道你说的三体指什么，也不知道你说的比较是谁跟谁比、比什么。提问时用词、描述必须准确

“无氢键的如（S和H）” 完全不知道你指什么，S作为氢键受体形成氢键？

作者
Author: lukas 时间: 2024-6-12 21:35

sobereva 发表于 2024-6-12 02:38
我不知道你说的三体指什么，也不知道你说的比较是谁跟谁比、比什么。提问时用词、描述必须准确

“无氢 ...

再次向您道歉。上面问题，就是对于没法找到键临界点的氢键，怎么衡量氢键强度。cvb指数在Multiwfn中可以计算不具备典型D-H...A氢键特征的体系,但不具有物理意义，如果某分子中存在类似D-H...A的结构但明显距离很远，但之间直线连接的路径上没有其他原子，此时cvb还具有物理意义吗？（这种弱相互作用力应该主要是静电作用）有更好的方法衡量分子中某两个不直接相连的原子之间的弱相互作用力吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-13 01:33

lukas 发表于 2024-6-12 21:35
再次向您道歉。上面问题，就是对于没法找到键临界点的氢键，怎么衡量氢键强度。cvb指数在Multiwfn中可以 ...

用IGMH或IRI，可用于没有BCP的氢键的分析，看IRI原文的讨论
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621（http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html）
使用IRI方法图形化考察化学体系中的化学键和弱相互作用
http://sobereva.com/598（http://bbs.keinsci.com/thread-23457-1-1.html）
一篇最全面介绍各种弱相互作用可视化分析方法的文章已发表！
http://sobereva.com/667（http://bbs.keinsci.com/thread-37629-1-1.html）

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