计算化学公社

标题: 为何使用cp2k模拟自由基与富勒烯反应，两者越来越远？ [打印本页]

作者
Author: zhangs 时间: 2024-6-11 11:28
标题: 为何使用cp2k模拟自由基与富勒烯反应，两者越来越远？
我使用的是multiwfn创建的cp2k输入文件，按道理应该是靠近，请各位老师解答

作者
Author: Huschein 时间: 2024-6-11 16:10
什么条件都不说，怎么设置也没说

作者
Author: zhangs 时间: 2024-6-11 17:03

Huschein 发表于 2024-6-11 16:10
什么条件都不说，怎么设置也没说

抱歉老师，我是想模拟富勒烯对自由基有清除或者淬灭作用，我这里用的是cp2k跑动力学，方法和基组是PBE/ TZV2P-MOLOPT-GTH,温度设置的是300K，但是这两个分子越来越远了，不知道是哪里出了问题

作者
Author: nusiew 时间: 2024-6-11 19:43
是不是对输出轨迹没有进行周期性变换呢？用的是真实原子坐标？

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-12 04:41
哪能不带色散校正
两个部分之间本来就没有静电吸引作用，再加上PBE描述不了分子间的色散吸引作用，分离开是极其正常的

作者
Author: zhangs 时间: 2024-6-12 09:45

sobereva 发表于 2024-6-12 04:41
哪能不带色散校正
两个部分之间本来就没有静电吸引作用，再加上PBE描述不了分子间的色散吸引作用，分离开 ...

感谢sob老师的解惑，那请问下我应该选择什么基组和方法

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-12 12:25

zhangs 发表于 2024-6-12 09:45
感谢sob老师的解惑，那请问下我应该选择什么基组和方法

加D3
仔细看
谈谈“计算时是否需要加DFT-D3色散校正？”
http://sobereva.com/413

如果加了D3还这样，设置初速度，让自由基往富勒烯这边打过来

作者
Author: Huschein 时间: 2024-6-12 12:31
反应是有能垒的，你想直接看到这个过程有点难，可以做个MetaD增强采样诱导这个过程

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