计算化学公社

标题: ADMP模拟关于温度压强定义以及系综问题 [打印本页]

作者
Author: xixizj 时间: 2024-6-11 11:53
标题: ADMP模拟关于温度压强定义以及系综问题
各位老师好。我对一个单分子进行ADMP模拟，没有用iop设置温度，也没设置压强。想问一下这样进行的ADMP是NVE系综模拟，还是默认温度压强下的NPT模拟呢。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-12 04:43
孤立单分子模拟没有压强和盒子的概念，既不是NVE也不是NPT

作者
Author: xixizj 时间: 2024-6-12 14:17

sobereva 发表于 2024-6-12 04:43
孤立单分子模拟没有压强和盒子的概念，既不是NVE也不是NPT

感谢卢老师的回复。如果是一个离子液体分子呢，这相当于是分别带正负电荷的两个分子了。这种情况下以上那种设置是NVE还是NPT呢

作者
Author: wzkchem5 时间: 2024-6-12 16:44

xixizj 发表于 2024-6-12 07:17
感谢卢老师的回复。如果是一个离子液体分子呢，这相当于是分别带正负电荷的两个分子了。这种情况下以上那 ...

这里的重点在于没定义盒子，而非孤立单分子。只要没有定义盒子，不管跑多少个分子的MD都既不是NVE也不是NVT、NPT，因为既无法定义体积又无法定义压强。如果定义了一个盒子，那么即便跑的是单分子，只要这个分子足够大（例如一个聚合物分子），仍然可以控压。如果分子很小，那么可以做恒容模拟，但不好做恒压模拟，因为体系太小，压强波动太大

作者
Author: xixizj 时间: 2024-6-13 16:30
清楚了，感谢您的回复。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)