计算化学公社

标题: 使用TK console合并结构时报错 [打印本页]

作者
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littleear    时间: 2024-6-13 15:35
标题: 使用TK console合并结构时报错
各位老师同学们好,我用packmol构建了一个模型,是水中的一个半球形CH4气泡,随后我想将该模型与VMD中构建的石墨烯合并时,报错
atomsel: setbonds: too many bonds in bondlist: 9685 9686 9687 9688 9689 9742 9702 9701 9703 9855 9859 9704 9740
Maximum of 12 bonds
在网上实在查不到解决方法了,求助各位~
(不知道为啥上传不了那个用packmol构建的pdb模型
作者
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sobereva    时间: 2024-6-14 02:02
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以节约论坛空间、节约下载耗时。不要试图不压缩就上传超大的pdb文件

说清楚怎么合并的
自己手动编辑pdb文件总能合并成功

作者
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littleear    时间: 2024-6-20 11:28
sobereva 发表于 2024-6-14 02:02
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以节约 ...

好的社长,我再去试试,非常感谢~




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