计算化学公社

标题: 向金属进行加成的反应,柔性扫描结果没有最高点,请问这是怎么回事呢? [打印本页]

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candicechen    时间: 2024-6-14 10:57
标题: 向金属进行加成的反应,柔性扫描结果没有最高点,请问这是怎么回事呢?
各位老师好,我做了一个过渡金属催化过程中,向金属进行加成反应的过渡态搜索。先是对体系进行了限制性优化,确定了有这个过渡态存在,但是进行过渡态搜索时,一直没找到对应的伸缩振动的过渡态。现在是对整个体系进行了柔性扫描,但是一直没有出现极大值点,请问这该怎么解决呢?

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sai77    时间: 2024-6-14 11:55
扫描的初始结构不太合理,B离金属中心太近了
可以先把氧化加成的产物结构优化出来,再扫描B-H键距离缩短

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candicechen    时间: 2024-6-14 16:19
sai77 发表于 2024-6-14 11:55
扫描的初始结构不太合理,B离金属中心太近了
可以先把氧化加成的产物结构优化出来,再扫描B-H键距离缩短

嗯嗯,这是反向扫描的意思吗?我优化出来的结构的B和金属的距离也挺近的
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candicechen    时间: 2024-6-14 17:18
sai77 发表于 2024-6-14 11:55
扫描的初始结构不太合理,B离金属中心太近了
可以先把氧化加成的产物结构优化出来,再扫描B-H键距离缩短

老师,不好意思,再问一下,我的最开始的B-H键的键长是1.2,加成后优化的产物的B-H键长是1.3,但是做限制性优化得到的最负频对应的结构的B-H键长是1.8,那我现在用氧化加成产物做柔性扫描,设置成 B H S 10 -0.01,是合理的吗?
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sai77    时间: 2024-6-15 10:26
candicechen 发表于 2024-6-14 17:18
老师,不好意思,再问一下,我的最开始的B-H键的键长是1.2,加成后优化的产物的B-H键长是1.3,但是做限制 ...

加成的B-H键长不太正常,只变长这么一点
试试看吧
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Freeman    时间: 2024-6-15 22:17
限制性优化收敛了且有一个虚频,并不代表找到了过渡态。有虚频只说明能量沿着虚频方向二阶导数是负的,或者说势能面沿着虚频方向是向上凸的,既可能是过渡态,也可能是像个山脊一样的结构。你限制键长在1.8优化,有一个虚频,对应的正好是你给的扫描能量图1.8位置周围的上凸部分,并不是过渡态。
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candicechen    时间: 2024-6-17 10:52
Freeman 发表于 2024-6-15 22:17
限制性优化收敛了且有一个虚频,并不代表找到了过渡态。有虚频只说明能量沿着虚频方向二阶导数是负的,或者 ...

嗯嗯,我明白了,谢谢老师!




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