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标题: gmx跑MD模拟小体系分子N2H4被拆开 [打印本页]

作者
Author:
a-Student    时间: 2024-6-14 20:40
标题: gmx跑MD模拟小体系分子N2H4被拆开
打扰各位老师,请教个问题,如图跑N2H4肼纯相盒子,pdb文件NH2-NH2是有键相连的,跑完md后就全断了,变成了NH2了,请问老师这种情况有什么建议,不让分子散掉么?请老师指点下,麻烦各位老师,谢谢

作者
Author:
sobereva    时间: 2024-6-15 00:35
N-N的bond项大概率不合理,力常数太小,或者这项完全缺失了




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