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标题: lammps报错求助,lammps运行到一半终止模拟,并显示application aborted [打印本页]

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城堡主人    时间: 2024-6-15 21:08
标题: lammps报错求助,lammps运行到一半终止模拟,并显示application aborted
我想做有机物在760摄氏度 660摄氏度下的分解,在前辈给的In文件的基础上修改了一下,in文件如下 (, 下载次数 Times of downloads: 9) ,原本设计的跑4000000步,但是最后总是跑了600000步就自动终止了,显示信息如下Total # of neighbors = 217093
Ave neighs/atom = 328.92879
Neighbor list builds = 5000
Dangerous builds not checked
WARNING: One or more atoms are time integrated more than once (src/modify.cpp:289)
Setting up Verlet ru
job aborted:
[ranks] message
[0-1] terminated
[2] application aborted
aborting MPI_COMM_WORLD (comm=0x44000000), error 1, comm rank 2
[3] terminated
[4] application aborted
aborting MPI_COMM_WORLD (comm=0x44000000), error 1, comm rank 4
[5] terminated
---- error analysis -----
[2,4] on LAPTOP10JM00UJ
lmp aborted the job. abort code 1
---- error analysis -----
PS C:\TRY>
然后我查阅相关资料,说是用6核运行不行,或者是执行mpiexec -np 6 lmp -in .\in-relax.txt的时候,文件名错了,然后我该成4核,并且按tab键自动写文件名又试了一次,还是不行,想问下这是遇到了什么问题。
还有就是基于这600000步,前590000步都不分解,到最后100-200步突然就分解了,想问下这是出了什么问题,species文件是这么显示的
#  Timestep    No_Moles    No_Specs       C4OH8          O2
     599706         220           2          20         200
#  Timestep    No_Moles    No_Specs       C4OH8          O2
     599806         220           2          20         200
#  Timestep    No_Moles    No_Specs       C4OH8          O2
     599906         220           2          20         200
#  Timestep    No_Moles    No_Specs       C4OH8          O2
     600006         220           2          20         200
#  Timestep    No_Moles    No_Specs       C4OH8          O2
     600106         220           2          20         200
#  Timestep    No_Moles    No_Specs       C4OH8      C4O3H8          O2
     600206         219           3          19           1         199
#  Timestep    No_Moles    No_Specs       C4OH8      C4O3H8          O2
     600306         219           3          19           1         199
#  Timestep    No_Moles    No_Specs       C4OH7         O4H       C4OH8      C4O3H8         O2H           H          O2
     600406         217           7           4           1          13           3           2           1         193
#  Timestep    No_Moles    No_Specs        C3H5        COH2         O2H       C4OH8         COH       CO2H2      C2O2H3           H       C4OH7      C2O2H4       C2OH3       C4OH5      C3O2H4        COH3       C4OH6         O4H      C4O3H6          H2       C4OH3       C4OH4          O2
     600506         230          21           1           1          21           2           1           1           1           9           5           1           1           2           1           1           4           1           1           2           1           1         172

这是我用的立场文件和初始建模 (, 下载次数 Times of downloads: 3) (, 下载次数 Times of downloads: 3)





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