计算化学公社
标题:
lammps报错求助,lammps运行到一半终止模拟,并显示application aborted
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作者Author:
城堡主人
时间:
2024-6-15 21:08
标题:
lammps报错求助,lammps运行到一半终止模拟,并显示application aborted
我想做有机物在760摄氏度 660摄氏度下的分解,在前辈给的In文件的基础上修改了一下,in文件如下
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,原本设计的跑4000000步,但是最后总是跑了600000步就自动终止了,显示信息如下Total # of neighbors = 217093
Ave neighs/atom = 328.92879
Neighbor list builds = 5000
Dangerous builds not checked
WARNING: One or more atoms are time integrated more than once (src/modify.cpp:289)
Setting up Verlet ru
job aborted:
[ranks] message
[0-1] terminated
[2] application aborted
aborting MPI_COMM_WORLD (comm=0x44000000), error 1, comm rank 2
[3] terminated
[4] application aborted
aborting MPI_COMM_WORLD (comm=0x44000000), error 1, comm rank 4
[5] terminated
---- error analysis -----
[2,4] on LAPTOP10JM00UJ
lmp aborted the job. abort code 1
---- error analysis -----
PS C:\TRY>
然后我查阅相关资料,说是用6核运行不行,或者是执行mpiexec -np 6 lmp -in .\in-relax.txt的时候,文件名错了,然后我该成4核,并且按tab键自动写文件名又试了一次,还是不行,想问下这是遇到了什么问题。
还有就是基于这600000步,前590000步都不分解,到最后100-200步突然就分解了,想问下这是出了什么问题,species文件是这么显示的
# Timestep No_Moles No_Specs C4OH8 O2
599706 220 2 20 200
# Timestep No_Moles No_Specs C4OH8 O2
599806 220 2 20 200
# Timestep No_Moles No_Specs C4OH8 O2
599906 220 2 20 200
# Timestep No_Moles No_Specs C4OH8 O2
600006 220 2 20 200
# Timestep No_Moles No_Specs C4OH8 O2
600106 220 2 20 200
# Timestep No_Moles No_Specs C4OH8 C4O3H8 O2
600206 219 3 19 1 199
# Timestep No_Moles No_Specs C4OH8 C4O3H8 O2
600306 219 3 19 1 199
# Timestep No_Moles No_Specs C4OH7 O4H C4OH8 C4O3H8 O2H H O2
600406 217 7 4 1 13 3 2 1 193
# Timestep No_Moles No_Specs C3H5 COH2 O2H C4OH8 COH CO2H2 C2O2H3 H C4OH7 C2O2H4 C2OH3 C4OH5 C3O2H4 COH3 C4OH6 O4H C4O3H6 H2 C4OH3 C4OH4 O2
600506 230 21 1 1 21 2 1 1 1 9 5 1 1 2 1 1 4 1 1 2 1 1 172
这是我用的立场文件和初始建模
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