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标题: Vina多配体分子对接怎么知道其中任一配体单独的对接分数？ [打印本页]

作者
Author: aaaaaaaaaaa 时间: 2024-6-17 21:29
标题: Vina多配体分子对接怎么知道其中任一配体单独的对接分数？
本帖最后由 aaaaaaaaaaa 于 2024-6-17 21:32 编辑

各位老师好，
我使用vina对两个小分子分别进行单配体对接以及多配体（两个小分子一起）对接。
得到了结合能分数。
但我还是无法比较A小分子在B小分子作用下结合受体的能力变强or竞争抑制。
我需要知道多配体对接中A小分子在结合能分数的贡献（或者说这个pose有和受体结合能分数是多少）
有办法根据已知的多配体-受体结合复合体构象知道其中单一配体的对接分数吗？（比如说我把多配体的结果拆分成一个配体-受体的构象，可以从脚本中计算它的对接分数吗）

作者
Author: Serious 时间: 2024-6-18 11:16
1）要拆成单个配体，vina --score_only算对接分数；
2）不确定vina的打分能不能反映“A小分子在B小分子作用下与受体的结合能力”；

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