计算化学公社

标题: 求助用gmx select分析平面上某一粒子数随时间的变化 [打印本页]

作者
Author: 大风起兮 时间: 2024-6-17 21:33
标题: 求助用gmx select分析平面上某一粒子数随时间的变化
老师们，我想用gmx select分析平面上某一粒子数随时间的变化，比如碳酸钙上面的油分子，这个要怎么实现

作者
Author: lyj714 时间: 2024-6-17 22:01
直接用vmd结合tcl统计才是最好的选择。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-18 02:39
gmx select结合-oi和gromacs的selection选择语句（看手册）原理上可以实现，但我肯定自己写VMD tcl脚本，写几行就能轻松搞定
专门做动力学的人，VMD tcl脚本（或Python结合第三方统计分析库等）的编写是必须学的，否则碰到诸如这种小问题都费劲。北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）专有一节全面详细讲VMD tcl脚本的编写

作者
Author: 大风起兮 时间: 2024-6-18 14:36

sobereva 发表于 2024-6-18 02:39
gmx select结合-oi和gromacs的selection选择语句（看手册）原理上可以实现，但我肯定自己写VMD tcl脚本，写 ...

谢谢社长，我试试

作者
Author: 大风起兮 时间: 2024-6-18 14:36

lyj714 发表于 2024-6-17 22:01
直接用vmd结合tcl统计才是最好的选择。

谢谢你，我尝试一下

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