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标题: 利用vmd去除磷脂膜疏水区水分子的问题 [打印本页]

作者
Author: dayu8278 时间: 2024-6-18 13:00
标题: 利用vmd去除磷脂膜疏水区水分子的问题
各位老师好：

请问下各位老师，在vmd中去掉磷脂膜疏水区的水分子，对于膜尺寸较小的体系可以用卢老师教程的命令：

same resid as waters and (z<10 or z> 60) or not waters，效果见左图。

但是对于膜尺寸较大的体系（右图），就不行了。我认为是gro或者pdb文件中分子的resid最多到99999，然后又重新开始计数，所以用上述命令无法适用于大膜体系，请问各位老师有什么好方法可以处理这个问题吗

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-18 13:01
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作者
Author: dayu8278 时间: 2024-6-18 13:07

sobereva 发表于 2024-6-18 13:01
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感谢卢老师

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