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标题: 求助，如何将核酸的轴沿z轴放置 [打印本页]

作者
Author: zhijiu 时间: 2024-6-18 16:44
标题: 求助，如何将核酸的轴沿z轴放置
各位老师好，我庸chimera生成了一个核酸结构，轴的取向是倾斜的。我先用gmx editconf中的princ的指令，将核酸的中心轴沿着x轴，然后再rotate，沿着y轴旋转90度，得到了一个核酸结构。但是这个核酸结构的中心轴并不是完全沿着z轴方向的，而是会有一些倾斜，请问这个该如何解决？

作者
Author: 凉才快 时间: 2024-6-18 16:53
精度要求不高的话，用VMD调应该可以

作者
Author: zhijiu 时间: 2024-6-18 18:42

凉才快发表于 2024-6-18 16:53
精度要求不高的话，用VMD调应该可以

谢谢老师，但是因为要沿z轴做一些统计，所以就还是要做的比较精准

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-18 18:48
本来中心轴就没有唯一的定义。直接在VMD里手动旋转成想要的朝向就完了，记得用正交视角并且把视角平行于笛卡尔轴避免视觉误差

作者
Author: dayu8278 时间: 2024-6-19 08:45
可以用pymol

rotate z, 30, XXX(你的旋转对象)

绕着z轴旋转30度

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