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标题: 在autoff 中用OPLS-2009IL力场生成硫酸根拓扑文件,但是键参数感觉不太对, [打印本页]

作者
Author:
Simll    时间: 2024-6-18 21:10
标题: 在autoff 中用OPLS-2009IL力场生成硫酸根拓扑文件,但是键参数感觉不太对,
我查了下 OPLSAA力场中bond_coeff为K和r,其单位分别是kcal/mol/Å2和Å。用这个autoff生成的感觉不太一样,是单位不同导致的吗

作者
Author:
Yuki_    时间: 2024-9-14 09:39
好像是的,因为autoff中的势阱深度的单位是(kJ·mol-1),其他参数估计也是和lammps中的real单位制的单位会有所不同




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