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标题: 求助：锂离子在gaff或者在opls力场下的参数 [打印本页]

作者
Author: 打豆豆的灰鸭 时间: 2024-6-19 10:24
标题: 求助：锂离子在gaff或者在opls力场下的参数
锂离子在gaff或者在opls力场下的参数

作者
Author: 低调的板凳 时间: 2024-6-19 10:32
gaff本身没有锂离子吧，你可以从常见的amber力场里面找一下，通用的

作者
Author: 打豆豆的灰鸭 时间: 2024-6-19 10:46

低调的板凳发表于 2024-6-19 10:32
gaff本身没有锂离子吧，你可以从常见的amber力场里面找一下，通用的

好的，谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-19 11:53
KBFF、Merz的离子参数也都兼容GAFF

作者
Author: 牧生 时间: 2024-6-19 13:59
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.langmuir.3c01432

文献里面有现成的哦，兼容GAFF

; Merz JCIM 2021 Monovalent HFE fit for OPC3 ; DOI: 10.1021/acs.jcim.0c01390
Li 3 6.94 0.0000 A 2.2628827441e-01 1.3625196000e-02

作者
Author: 打豆豆的灰鸭 时间: 2024-6-19 15:00

sobereva 发表于 2024-6-19 11:53
KBFF、Merz的离子参数也都兼容GAFF

老师，体系里其他分子用了opls力场，可以同时使用吗

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-20 00:31

打豆豆的灰鸭发表于 2024-6-19 15:00
老师，体系里其他分子用了opls力场，可以同时使用吗

GAFF和OPLS-AA不兼容
能用OPLS-AA描述的体系都能用sobtop基于GAFF/GAFF2力场创建拓扑文件来描述，没什么理由非得刻意用原子类型名非常混乱的OPLS-AA

作者
Author: 打豆豆的灰鸭 时间: 2024-6-20 15:35

牧生发表于 2024-6-19 13:59
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.langmuir.3c01432

文献里面有现成的哦，兼容GAFF

想问一下，这个参数单位是什么，是nm 和KJ/mol吗

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