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标题: 如何统计vasp计算的AIMD轨迹里的某一个原子在所有帧的坐标 [打印本页]

作者
Author: 飞飞fly 时间: 2024-6-20 16:43
标题: 如何统计vasp计算的AIMD轨迹里的某一个原子在所有帧的坐标
老师们好，请问如何统计vasp计算的AIMD轨迹里的某一个原子在所有帧的坐标？我想用这种办法画某个原子的轨迹图，用VMD算出来的总是会有些轨迹超出计算盒子。

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-20 17:30
你描述的前后根本不是同一个问题
解决后者就用pbc wrap -all命令把原子卷进盒子里就完了

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