计算化学公社

标题: 安装了原版g16和编译过的g16-UF21D，但是输出文件中调用的还是原版的g16来计算 [打印本页]

作者
Author: ynzhou 时间: 2024-6-21 16:13
标题: 安装了原版g16和编译过的g16-UF21D，但是输出文件中调用的还是原版的g16来计算
我安装了一个原版g16和一个编译过的g16-UF21D，执行命令写的：/home/ynzhou/soft/g16-UF21D/g16 < xxx.gjf > xxx.log，但是输出文件中调用的还是原版的g16来计算，请问是什么原因？环境变量和输出文件如下图：

作者
Author: zjxitcc 时间: 2024-6-21 16:33
本帖最后由 zjxitcc 于 2024-6-21 18:31 编辑

（1）无论是原版Gaussian还是自己编译的，都不需要写export GAUSS_EXEDIR这一行。这点跟这个问题没有直接关联，但略为重要，平时就应该修正过来。注意，不要回复我诸如“我以前这么写也能正常算”之类的话。
（2）若坚持写在~/.bashrc中，最好注释掉一个版本，只留一个版本生效；若不坚持，则可在~/.bashrc中保留原版g16环境变量，而使用Shell脚本提交Gaussian任务，脚本前三行写自编版Gaussian环境变量，第四行写g16 xxx.gjf。
（3）不需要这么复杂地运行/home/ynzhou/soft/g16-UF21D/g16 < xxx.gjf > xxx.log。写好环境变量后，直接g16 xxx.gjf即可，而且可以在任意目录下敲g16，无需绝对路径。
（4）Gaussian目录必须是g16/，不可以改成g16-UF21D。合理的改法是新建一个目录叫g16-UF21D，然后里面有一个自编版g16/，即套一层壳，然后g16root做相应修改。

作者
Author: abin 时间: 2024-6-21 17:35
g16root 两次内容都一样呀……

如果不一样的话，
按照逻辑，会启用第二次设定的内容。不会启用第一个g16

作者
Author: sobereva 时间: 2024-6-22 02:45
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “gaussian运行路径” 改了，以后务必注意！下次将删帖+扣分处理。

不要24小时内在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛里问同一问题，注意看群规（http://sobereva.com/QQrule.html），以及论坛置顶的论坛新社员必读贴

作者
Author: ynzhou 时间: 2024-6-22 10:34

zjxitcc 发表于 2024-6-21 16:33
（1）无论是原版Gaussian还是自己编译的，都不需要写export GAUSS_EXEDIR这一行。这点跟这个问题没有直接关 ...

谢谢老师的提醒，之前写的确实不规范，已经改正！

作者
Author: ynzhou 时间: 2024-6-22 10:35

sobereva 发表于 2024-6-22 02:45
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

第一次发帖，下次一定注意规范，谢谢社长提醒

作者
Author: ynzhou 时间: 2024-6-22 10:35

abin 发表于 2024-6-21 17:35
g16root 两次内容都一样呀……

最后发现是环境冲突了，已经解决，谢谢回答

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)