计算化学公社

标题: 求助:Dalton CC2 激发态计算报错 [打印本页]

作者
Author:
zizi    时间: 2024-6-23 00:03
标题: 求助:Dalton CC2 激发态计算报错
各位老师好,我尝试使用Dalton对过渡金属配合物的激发态进行CC2计算。前面的波函数计算已经收敛,但计算到CC2的部分时出现如下错误。我在作业运行过程中监控了内存使用情况,没有发现使用超过设定内存的情况。我在手册中搜索相关关键词,没有找到对于“CCSD_SORTAO NUMBAT”、"CCRDAO"等关键词的说明,所以不清楚应该如何纠错。初学Dalton,恳请各位老师指导,非常感谢!


作者
Author:
zjxitcc    时间: 2024-6-23 09:01
信息严重缺失,例如
(1)提交Dalton任务时,dalton -gb 后面写了几?(使用几GB内存)
(2)Dalton编译时有没加--int64?
(3)体系多少原子,多少基函数?
(4).dal文件关键词是什么,是否合理?

作者
Author:
zizi    时间: 2024-6-24 12:40
zjxitcc 发表于 2024-6-23 09:01
信息严重缺失,例如
(1)提交Dalton任务时,dalton -gb 后面写了几?(使用几GB内存)
(2)Dalton编译 ...

谢谢老师的回复!抱歉没有提供足够的信息,下面是一些详细信息:
(1)我在提交Dalton任务时候,写了“dalton -gb 960”,指定使用960Gb。
(2)我使用的Dalton版本为2020.1。是按照Sobereva老师的博文“量子化学程序Dalton的编译方法和运行方式简介”(http://sobereva.com/463)中的“1.4 编译Dalton的串行+MKL并行版”进行编译,编译时没有加“--int64”。请问老师我是否应该加入“--int64”重新进行编译?
(3)我的体系有91个原子,含有重金属,共896个基函数。
(4)这是我的.dal文件:
  1. **DALTON
  2. .RUN WAVE FUNCTIONS
  3. **WAVE FUNCTION
  4. .CC
  5. *SCF INP
  6. .MAX DIIS
  7. 1000
  8. *CC INP
  9. .CC2
  10. *CCEXCI
  11. .NCCEXCI
  12. 2
  13. **END OF DALTON
复制代码

感谢老师的耐心指导!
作者
Author:
zjxitcc    时间: 2024-6-24 12:48
本帖最后由 zjxitcc 于 2024-6-24 12:53 编辑
zizi 发表于 2024-6-24 12:40
谢谢老师的回复!抱歉没有提供足够的信息,下面是一些详细信息:
(1)我在提交Dalton任务时候,写了“d ...

没有加--int64编译的Dalton最多只能用16GB内存,因此-gb 960容易造成报错,也没有意义(暂且不论你的机器是否真有960GB内存可用)。从你的体系大小看有可能16GB内存不够,需要加--int64重新编译和安装Dalton。我有点怀疑Dalton的CC2是否真能算得动这么大的体系。

另外,我记得Dalton的CC默认不冻结 芯轨道,需要用户自己指定。注意通常情况下一定要指定,否则徒增计算量 结果还未必好。要自己在输出文件里检查被冻结 芯轨道的数目。

作者
Author:
zizi    时间: 2024-7-2 12:45
zjxitcc 发表于 2024-6-24 12:48
没有加--int64编译的Dalton最多只能用16GB内存,因此-gb 960容易造成报错,也没有意义(暂且不论你的机器 ...

谢谢老师,我按照您的建议重新编译了Dalton,现在可以使用更大的内存了。我参考gaussian结果,判断了考虑电子相关的轨道范围,设置冻结了46个轨道。但是由于体系较大,设置基组为def2-SVP,CC2计算进行了7天,coupled cluster CC2 iteration只完成了8圈,没有收敛。

我希望使用比TDDFT精度更高的方法计算激发态,对于这么大的体系,请问我应该如何改进计算的设置,才能算得动?或者,请问老师是否有其它更好的方法值得尝试?非常感谢您的耐心指导!
作者
Author:
wjc404    时间: 2024-7-2 13:31
本帖最后由 wjc404 于 2024-7-2 13:32 编辑

可以试试MRCC程序,其CC2方法有一些加速的策略,详见http://bbs.keinsci.com/thread-29156-1-1.html

也可以考虑双杂化泛函的TDDFT,使用ORCA软件开RI去算。

作者
Author:
zizi    时间: 2024-7-2 16:08
wjc404 发表于 2024-7-2 13:31
可以试试MRCC程序,其CC2方法有一些加速的策略,详见http://bbs.keinsci.com/thread-29156-1-1.html

也 ...

谢谢老师!我试试您建议的方法。
作者
Author:
Yaoyl    时间: 2024-12-10 14:49
zjxitcc 发表于 2024-6-23 09:01
信息严重缺失,例如
(1)提交Dalton任务时,dalton -gb 后面写了几?(使用几GB内存)
(2)Dalton编译 ...

老师您好,我想问一下您通过Multiwfn软件做出双光子光谱图后,它的纵坐标是摩尔吸收系数,怎么才能转换成双光子吸收系数呢?
作者
Author:
zjxitcc    时间: 2024-12-10 14:55
Yaoyl 发表于 2024-12-10 14:49
老师您好,我想问一下您通过Multiwfn软件做出双光子光谱图后,它的纵坐标是摩尔吸收系数,怎么才能转换成 ...

在本论坛上一个问题短时间内多处提问是不允许的,你很快就会受到警告。我没有“通过Multiwfn软件做出双光子光谱图”,不要问我。
作者
Author:
Yaoyl    时间: 2024-12-10 14:59
zjxitcc 发表于 2024-12-10 14:55
在本论坛上一个问题短时间内多处提问是不允许的,你很快就会受到警告。我没有“通过Multiwfn软件做出双光 ...

好的,谢谢老师提醒




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3