计算化学公社

标题: 使用gmx hbond命令计算氢键数量时该如何选择group？ [打印本页]

作者
Author: 12313 时间: 2024-6-24 11:26
标题: 使用gmx hbond命令计算氢键数量时该如何选择group？
各位老师好，我是新手，我想问一下在对蛋白配体大分子体系模拟完成后，使用gmx hbond指令对氢键数量进行分析时，该如何选择组别？或者是对于该体系进行氢键数量的分析时，一般会选择哪部分？
(, 下载次数 Times of downloads: 13)

作者
Author: dayu8278 时间: 2024-6-24 15:24
从你的Index文件来看，不应该选择1Protein和13MOL吗？

作者
Author: 12313 时间: 2024-6-24 15:51

dayu8278 发表于 2024-6-24 15:24
从你的Index文件来看，不应该选择1Protein和13MOL吗？

谢谢老师，那这个选择1和13的先后顺序有影响吗

作者
Author: dayu8278 时间: 2024-6-24 16:58

12313 发表于 2024-6-24 15:51
谢谢老师，那这个选择1和13的先后顺序有影响吗

你和我之间距离，我和你之间的距离，你觉有区别吗呢？

作者
Author: 12313 时间: 2024-6-24 18:08

dayu8278 发表于 2024-6-24 16:58
你和我之间距离，我和你之间的距离，你觉有区别吗呢？

哈哈哈哈，好的明白了谢谢

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)