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标题: 多核运行,popt版本报错 [打印本页]

作者
Author: 1764360701 时间: 2024-6-24 19:00
标题: 多核运行,popt版本报错
服务器44个核，cp2k.popt多核运行报错，最多只能用22个核是怎么回事

作者
Author: ThualishuT 时间: 2024-6-25 02:13
根据你的描述，我猜你指的“44核”应该是指44个逻辑核心，也就是说你的服务器只有22个物理核心。OpenMPI默认将能并行的最大进程数设置为与物理核心数相同，此时自然最多只能“用上”22核，这样的设置是合理的，能获得最大的并行效率，具体原因见http://sobereva.com/392。如果不属于上述情况，那就要检查相关设置是否正确。

作者
Author: snljty2 时间: 2024-6-25 10:18
如楼上所说，执行

echo $(($(cat /proc/cpuinfo | grep 'physical id' | sort | uniq | wc -l | awk '{print int($0)}')*$(cat /proc/cpuinfo | grep 'core id' | sort | uniq | wc -l | awk '{print int($0)}')))

复制代码

命令查看你的CPU（被识别到的部分）到底有多少物理核心。

作者
Author: 喝杯热水 时间: 2024-6-25 11:54
想突破这一点，mpirun后面加一个 --oversubscribe 就可以了。

作者
Author: 1764360701 时间: 2024-6-25 12:27

ThualishuT 发表于 2024-6-25 02:13
根据你的描述，我猜你指的“44核”应该是指44个逻辑核心，也就是说你的服务器只有22个物理核心。OpenMPI默 ...

22个核心也不行，只能20

作者
Author: 喝杯热水 时间: 2024-6-25 15:59

1764360701 发表于 2024-6-25 12:27
22个核心也不行，只能20

你试试用mpirun --oversubscribe -np 44 来执行。

作者
Author: kirSTY 时间: 2024-9-3 20:26
np后边接逻辑核心数，一般来说最好是完全平方数，且小于等于物理核心数。我自己测试超线程运行一般都会拖慢速度

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